Formatet från kameran (en Sony eller Panasonic kanske?) är antagligen AVCHD och då bör video redan vara i lämpligt format (H.264/MPEG-4 Part 10) för en MP4-fil, så någon försämringen borde absolut inte ske, i så fall är något fel inställt.
Att det är MP4-fil du vill ha säger i sig inget om formatet på de video- och ljuddata som filen innehåller, men i regel är det H.264 precis som i AVCHD eller MPEG-4 (Part 2)[size=3].[/size]
Själv skulle jag aldrig använda iSkysofts produkter. Jag använder alltid ffmpeg om jag ska konvertera video-filer. Med största sannolikhet använder iSkysoft också ffmpeg fortfarande. Åtminstone gjorde de så tidigare (olagligt). Så att betala för iSkysofts produkter är tyvärr inte bara bortslösade pengar (ffmpeg kostar inget), utan även stöd till ett företag som säljer andras arbete under eget namn. Se här: http://roundup.libav.org/issue927
Tyvärr kunde jag inte hjälpa dig med ditt problem, men kanske jag lyckas få någon att avstå från iSkysofts "produkter".
ffmpeg är kanske inte så lätt att använda om man inte är tekniskt lagd, men det finns många program som underlättar det.